Речь то о применении в рамках ардуиноIDE "референса" - компараторов там "по умолчанию" не предусмотрено (как и сторожевой собаки) - надо делать "отсебятину"(или использовать "сторонние библиотеки"), а касательно АЦП - все необходимое уже встроено.
Ежли "за пределами" адуринки - в той же АВР (микрочип) студио - там что хош делай хош на ассемблере, хош на Си.